Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
RSPH4AQ5TD94 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
RSPH4AQ5TD94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
RSPH4AQ5TD94 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
RSPH4AQ5TD94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RSPH4AQ5TD94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
RSPH4AQ5TD94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RSPH4AQ5TD94 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RSPH4AQ5TD94 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
RSPH4AQ5TD94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RSPH4AQ5TD94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RSPH4AQ5TD94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RSPH4AQ5TD94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSPH4AQ5TD94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
RSPH4AQ5TD94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RSPH4AQ5TD94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
RSPH4AQ5TD94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RSPH4AQ5TD94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RSPH4AQ5TD94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RSPH4AQ5TD94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RSPH4AQ5TD94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
RSPH4AQ5TD94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
RSPH4AQ5TD94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
RSPH4AQ5TD94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RSPH4AQ5TD94 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RSPH4AQ5TD94 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RSPH4AQ5TD94 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RSPH4AQ5TD94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RSPH4AQ5TD94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RSPH4AQ5TD94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RSPH4AQ5TD94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RSPH4AQ5TD94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RSPH4AQ5TD94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
RSPH4AQ5TD94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RSPH4AQ5TD94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RSPH4AQ5TD94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSPH4AQ5TD94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSPH4AQ5TD94 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSPH4AQ5TD94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms