Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATPAF1Q5TC12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATPAF1Q5TC12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATPAF1Q5TC12 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATPAF1Q5TC12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATPAF1Q5TC12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATPAF1Q5TC12 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATPAF1Q5TC12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms