Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPTPQ5TA50 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPTPQ5TA50 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPTPQ5TA50 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPTPQ5TA50 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPTPQ5TA50 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPTPQ5TA50 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPTPQ5TA50 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms