Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD3Q5T2D3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD3Q5T2D3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD3Q5T2D3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD3Q5T2D3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD3Q5T2D3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUD3Q5T2D3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms