Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PERM1Q5SV97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PERM1Q5SV97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PERM1Q5SV97 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PERM1Q5SV97 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PERM1Q5SV97 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PERM1Q5SV97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PERM1Q5SV97 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PERM1Q5SV97 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PERM1Q5SV97 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PERM1Q5SV97 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PERM1Q5SV97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms