Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MIA3Q5JRA6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIA3Q5JRA6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIA3Q5JRA6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIA3Q5JRA6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIA3Q5JRA6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIA3Q5JRA6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIA3Q5JRA6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIA3Q5JRA6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIA3Q5JRA6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIA3Q5JRA6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIA3Q5JRA6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms