Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM249Q2WGJ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM249Q2WGJ8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM249Q2WGJ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM249Q2WGJ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM249Q2WGJ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms