Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
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