Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SWI5Q1ZZU3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SWI5Q1ZZU3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SWI5Q1ZZU3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SWI5Q1ZZU3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SWI5Q1ZZU3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SWI5Q1ZZU3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SWI5Q1ZZU3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SWI5Q1ZZU3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SWI5Q1ZZU3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SWI5Q1ZZU3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SWI5Q1ZZU3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SWI5Q1ZZU3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SWI5Q1ZZU3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SWI5Q1ZZU3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SWI5Q1ZZU3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SWI5Q1ZZU3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWI5Q1ZZU3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SWI5Q1ZZU3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SWI5Q1ZZU3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SWI5Q1ZZU3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWI5Q1ZZU3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SWI5Q1ZZU3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SWI5Q1ZZU3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWI5Q1ZZU3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWI5Q1ZZU3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SWI5Q1ZZU3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SWI5Q1ZZU3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SWI5Q1ZZU3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWI5Q1ZZU3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SWI5Q1ZZU3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SWI5Q1ZZU3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SWI5Q1ZZU3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SWI5Q1ZZU3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SWI5Q1ZZU3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SWI5Q1ZZU3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SWI5Q1ZZU3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SWI5Q1ZZU3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SWI5Q1ZZU3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SWI5Q1ZZU3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SWI5Q1ZZU3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWI5Q1ZZU3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWI5Q1ZZU3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SWI5Q1ZZU3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SWI5Q1ZZU3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SWI5Q1ZZU3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SWI5Q1ZZU3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWI5Q1ZZU3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SWI5Q1ZZU3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SWI5Q1ZZU3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SWI5Q1ZZU3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SWI5Q1ZZU3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SWI5Q1ZZU3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SWI5Q1ZZU3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SWI5Q1ZZU3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SWI5Q1ZZU3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SWI5Q1ZZU3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SWI5Q1ZZU3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SWI5Q1ZZU3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SWI5Q1ZZU3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SWI5Q1ZZU3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWI5Q1ZZU3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWI5Q1ZZU3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWI5Q1ZZU3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWI5Q1ZZU3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWI5Q1ZZU3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWI5Q1ZZU3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWI5Q1ZZU3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWI5Q1ZZU3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SWI5Q1ZZU3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWI5Q1ZZU3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWI5Q1ZZU3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWI5Q1ZZU3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWI5Q1ZZU3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWI5Q1ZZU3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWI5Q1ZZU3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SWI5Q1ZZU3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SWI5Q1ZZU3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWI5Q1ZZU3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWI5Q1ZZU3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SWI5Q1ZZU3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWI5Q1ZZU3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWI5Q1ZZU3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWI5Q1ZZU3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SWI5Q1ZZU3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWI5Q1ZZU3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWI5Q1ZZU3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SWI5Q1ZZU3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SWI5Q1ZZU3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SWI5Q1ZZU3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SWI5Q1ZZU3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SWI5Q1ZZU3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SWI5Q1ZZU3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SWI5Q1ZZU3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SWI5Q1ZZU3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWI5Q1ZZU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWI5Q1ZZU3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWI5Q1ZZU3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWI5Q1ZZU3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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