Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCK2Q16822 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCK2Q16822 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCK2Q16822 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCK2Q16822 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCK2Q16822 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCK2Q16822 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCK2Q16822 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCK2Q16822 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCK2Q16822 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCK2Q16822 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCK2Q16822 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCK2Q16822 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCK2Q16822 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK2Q16822 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCK2Q16822 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK2Q16822 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCK2Q16822 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCK2Q16822 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms