Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF2Q15527 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF2Q15527 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF2Q15527 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SURF2Q15527 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SURF2Q15527 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF2Q15527 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF2Q15527 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms