Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLR1Q15399 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR1Q15399 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR1Q15399 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR1Q15399 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
TLR1Q15399 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR1Q15399 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR1Q15399 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR1Q15399 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR1Q15399 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLR1Q15399 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLR1Q15399 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR1Q15399 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR1Q15399 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR1Q15399 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLR1Q15399 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR1Q15399 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR1Q15399 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR1Q15399 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR1Q15399 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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