Protein–RNA interactions for Protein: Q15170

TCEAL1, Transcription elongation factor A protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL1Q15170 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCEAL1Q15170 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCEAL1Q15170 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCEAL1Q15170 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TCEAL1Q15170 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCEAL1Q15170 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCEAL1Q15170 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCEAL1Q15170 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCEAL1Q15170 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCEAL1Q15170 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCEAL1Q15170 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCEAL1Q15170 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCEAL1Q15170 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCEAL1Q15170 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCEAL1Q15170 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCEAL1Q15170 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCEAL1Q15170 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TCEAL1Q15170 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCEAL1Q15170 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCEAL1Q15170 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCEAL1Q15170 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
TCEAL1Q15170 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEAL1Q15170 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEAL1Q15170 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEAL1Q15170 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCEAL1Q15170 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCEAL1Q15170 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms