Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACAP1Q15027 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACAP1Q15027 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACAP1Q15027 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACAP1Q15027 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACAP1Q15027 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACAP1Q15027 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACAP1Q15027 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ACAP1Q15027 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ACAP1Q15027 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACAP1Q15027 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACAP1Q15027 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACAP1Q15027 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ACAP1Q15027 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ACAP1Q15027 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms