Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A2Q14055 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL9A2Q14055 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL9A2Q14055 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL9A2Q14055 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A2Q14055 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A2Q14055 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL9A2Q14055 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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