Protein–RNA interactions for Protein: Q13571

LAPTM5, Lysosomal-associated transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM5Q13571 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAPTM5Q13571 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAPTM5Q13571 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAPTM5Q13571 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAPTM5Q13571 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAPTM5Q13571 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAPTM5Q13571 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAPTM5Q13571 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAPTM5Q13571 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAPTM5Q13571 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAPTM5Q13571 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAPTM5Q13571 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAPTM5Q13571 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAPTM5Q13571 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAPTM5Q13571 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAPTM5Q13571 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAPTM5Q13571 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAPTM5Q13571 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAPTM5Q13571 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAPTM5Q13571 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAPTM5Q13571 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAPTM5Q13571 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAPTM5Q13571 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAPTM5Q13571 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAPTM5Q13571 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms