Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HDAC1Q13547 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HDAC1Q13547 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HDAC1Q13547 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HDAC1Q13547 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HDAC1Q13547 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HDAC1Q13547 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HDAC1Q13547 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HDAC1Q13547 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HDAC1Q13547 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HDAC1Q13547 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HDAC1Q13547 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HDAC1Q13547 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDAC1Q13547 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HDAC1Q13547 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HDAC1Q13547 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HDAC1Q13547 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HDAC1Q13547 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HDAC1Q13547 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HDAC1Q13547 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HDAC1Q13547 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
HDAC1Q13547 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.79■■■■□ 3
HDAC1Q13547 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HDAC1Q13547 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HDAC1Q13547 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HDAC1Q13547 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
HDAC1Q13547 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HDAC1Q13547 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HDAC1Q13547 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC1Q13547 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
HDAC1Q13547 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HDAC1Q13547 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
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