Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPRL3Q12980 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPRL3Q12980 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPRL3Q12980 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPRL3Q12980 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPRL3Q12980 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPRL3Q12980 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPRL3Q12980 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPRL3Q12980 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPRL3Q12980 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPRL3Q12980 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPRL3Q12980 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPRL3Q12980 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPRL3Q12980 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPRL3Q12980 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPRL3Q12980 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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