Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSM1Q08AH1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM1Q08AH1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM1Q08AH1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM1Q08AH1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM1Q08AH1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSM1Q08AH1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSM1Q08AH1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSM1Q08AH1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSM1Q08AH1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSM1Q08AH1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSM1Q08AH1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSM1Q08AH1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSM1Q08AH1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms