Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCK1Q08629 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOCK1Q08629 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCK1Q08629 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPOCK1Q08629 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPOCK1Q08629 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCK1Q08629 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms