Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRSF4Q08170 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF4Q08170 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF4Q08170 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF4Q08170 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF4Q08170 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF4Q08170 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF4Q08170 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF4Q08170 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF4Q08170 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF4Q08170 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF4Q08170 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF4Q08170 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF4Q08170 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms