Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SOS1Q07889 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SOS1Q07889 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SOS1Q07889 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SOS1Q07889 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SOS1Q07889 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SOS1Q07889 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SOS1Q07889 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SOS1Q07889 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SOS1Q07889 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SOS1Q07889 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SOS1Q07889 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SOS1Q07889 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SOS1Q07889 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SOS1Q07889 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SOS1Q07889 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SOS1Q07889 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SOS1Q07889 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SOS1Q07889 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SOS1Q07889 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SOS1Q07889 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SOS1Q07889 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SOS1Q07889 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SOS1Q07889 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SOS1Q07889 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SOS1Q07889 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SOS1Q07889 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SOS1Q07889 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SOS1Q07889 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SOS1Q07889 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SOS1Q07889 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms