Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RACK1P63244 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RACK1P63244 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RACK1P63244 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RACK1P63244 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RACK1P63244 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RACK1P63244 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RACK1P63244 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RACK1P63244 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RACK1P63244 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RACK1P63244 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RACK1P63244 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RACK1P63244 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RACK1P63244 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RACK1P63244 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RACK1P63244 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RACK1P63244 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RACK1P63244 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RACK1P63244 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RACK1P63244 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RACK1P63244 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RACK1P63244 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RACK1P63244 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RACK1P63244 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RACK1P63244 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RACK1P63244 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RACK1P63244 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RACK1P63244 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RACK1P63244 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RACK1P63244 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RACK1P63244 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RACK1P63244 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RACK1P63244 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RACK1P63244 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RACK1P63244 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RACK1P63244 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RACK1P63244 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RACK1P63244 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RACK1P63244 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RACK1P63244 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RACK1P63244 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RACK1P63244 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RACK1P63244 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RACK1P63244 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RACK1P63244 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RACK1P63244 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RACK1P63244 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RACK1P63244 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RACK1P63244 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RACK1P63244 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RACK1P63244 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RACK1P63244 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RACK1P63244 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RACK1P63244 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RACK1P63244 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RACK1P63244 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RACK1P63244 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RACK1P63244 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RACK1P63244 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RACK1P63244 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RACK1P63244 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RACK1P63244 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RACK1P63244 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RACK1P63244 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RACK1P63244 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RACK1P63244 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RACK1P63244 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RACK1P63244 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RACK1P63244 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RACK1P63244 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RACK1P63244 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RACK1P63244 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RACK1P63244 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RACK1P63244 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RACK1P63244 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RACK1P63244 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RACK1P63244 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RACK1P63244 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RACK1P63244 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RACK1P63244 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RACK1P63244 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RACK1P63244 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RACK1P63244 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RACK1P63244 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RACK1P63244 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RACK1P63244 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RACK1P63244 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RACK1P63244 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RACK1P63244 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RACK1P63244 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RACK1P63244 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RACK1P63244 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RACK1P63244 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RACK1P63244 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RACK1P63244 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RACK1P63244 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RACK1P63244 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RACK1P63244 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RACK1P63244 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RACK1P63244 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms