Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIMK2P53671 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIMK2P53671 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LIMK2P53671 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIMK2P53671 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIMK2P53671 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LIMK2P53671 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIMK2P53671 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LIMK2P53671 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMK2P53671 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIMK2P53671 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIMK2P53671 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIMK2P53671 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMK2P53671 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIMK2P53671 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIMK2P53671 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIMK2P53671 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIMK2P53671 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LIMK2P53671 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIMK2P53671 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms