Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THBS3P49746 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS3P49746 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS3P49746 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS3P49746 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS3P49746 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS3P49746 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS3P49746 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS3P49746 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS3P49746 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS3P49746 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS3P49746 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS3P49746 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS3P49746 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS3P49746 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS3P49746 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS3P49746 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS3P49746 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS3P49746 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS3P49746 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS3P49746 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS3P49746 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS3P49746 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THBS3P49746 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS3P49746 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS3P49746 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS3P49746 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THBS3P49746 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THBS3P49746 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THBS3P49746 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THBS3P49746 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THBS3P49746 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS3P49746 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS3P49746 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS3P49746 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THBS3P49746 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS3P49746 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS3P49746 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS3P49746 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS3P49746 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS3P49746 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS3P49746 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS3P49746 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS3P49746 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THBS3P49746 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS3P49746 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS3P49746 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS3P49746 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THBS3P49746 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THBS3P49746 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THBS3P49746 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS3P49746 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS3P49746 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
THBS3P49746 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS3P49746 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS3P49746 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS3P49746 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS3P49746 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS3P49746 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS3P49746 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS3P49746 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS3P49746 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THBS3P49746 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THBS3P49746 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THBS3P49746 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THBS3P49746 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THBS3P49746 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS3P49746 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS3P49746 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS3P49746 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS3P49746 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS3P49746 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS3P49746 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THBS3P49746 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
THBS3P49746 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS3P49746 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS3P49746 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS3P49746 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS3P49746 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS3P49746 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS3P49746 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS3P49746 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS3P49746 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS3P49746 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS3P49746 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS3P49746 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS3P49746 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS3P49746 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS3P49746 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS3P49746 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS3P49746 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS3P49746 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS3P49746 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS3P49746 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THBS3P49746 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THBS3P49746 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THBS3P49746 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THBS3P49746 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THBS3P49746 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THBS3P49746 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms