Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP9P49458 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP9P49458 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP9P49458 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP9P49458 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP9P49458 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP9P49458 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP9P49458 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP9P49458 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP9P49458 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP9P49458 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP9P49458 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP9P49458 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP9P49458 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP9P49458 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SRP9P49458 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRP9P49458 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRP9P49458 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRP9P49458 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRP9P49458 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRP9P49458 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRP9P49458 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRP9P49458 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRP9P49458 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SRP9P49458 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRP9P49458 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRP9P49458 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRP9P49458 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRP9P49458 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRP9P49458 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRP9P49458 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRP9P49458 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP9P49458 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP9P49458 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP9P49458 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP9P49458 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRP9P49458 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP9P49458 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP9P49458 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP9P49458 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRP9P49458 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRP9P49458 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRP9P49458 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP9P49458 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP9P49458 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP9P49458 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP9P49458 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP9P49458 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP9P49458 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP9P49458 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP9P49458 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP9P49458 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP9P49458 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP9P49458 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP9P49458 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP9P49458 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP9P49458 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP9P49458 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP9P49458 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP9P49458 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP9P49458 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP9P49458 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP9P49458 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP9P49458 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP9P49458 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP9P49458 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP9P49458 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP9P49458 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP9P49458 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP9P49458 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP9P49458 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP9P49458 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP9P49458 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP9P49458 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP9P49458 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP9P49458 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP9P49458 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP9P49458 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP9P49458 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP9P49458 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP9P49458 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP9P49458 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP9P49458 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP9P49458 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP9P49458 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP9P49458 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP9P49458 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP9P49458 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP9P49458 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP9P49458 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP9P49458 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRP9P49458 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRP9P49458 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP9P49458 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP9P49458 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP9P49458 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP9P49458 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP9P49458 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP9P49458 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP9P49458 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms