Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
IQGAP1P46940 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
IQGAP1P46940 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
IQGAP1P46940 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
IQGAP1P46940 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
IQGAP1P46940 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
IQGAP1P46940 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
IQGAP1P46940 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
IQGAP1P46940 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
IQGAP1P46940 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.01■■■■■ 4
IQGAP1P46940 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
IQGAP1P46940 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
IQGAP1P46940 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
IQGAP1P46940 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
IQGAP1P46940 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
IQGAP1P46940 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
IQGAP1P46940 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
IQGAP1P46940 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
IQGAP1P46940 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.9■■■■□ 3.98
IQGAP1P46940 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
IQGAP1P46940 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
IQGAP1P46940 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
IQGAP1P46940 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
IQGAP1P46940 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
IQGAP1P46940 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
IQGAP1P46940 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
IQGAP1P46940 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
IQGAP1P46940 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
IQGAP1P46940 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
IQGAP1P46940 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
IQGAP1P46940 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
IQGAP1P46940 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
IQGAP1P46940 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
IQGAP1P46940 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
IQGAP1P46940 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
IQGAP1P46940 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
IQGAP1P46940 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
IQGAP1P46940 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
IQGAP1P46940 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
IQGAP1P46940 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
IQGAP1P46940 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
IQGAP1P46940 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
IQGAP1P46940 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
IQGAP1P46940 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
IQGAP1P46940 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
IQGAP1P46940 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
IQGAP1P46940 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
IQGAP1P46940 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
IQGAP1P46940 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.47■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
IQGAP1P46940 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
IQGAP1P46940 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
IQGAP1P46940 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
IQGAP1P46940 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
IQGAP1P46940 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
IQGAP1P46940 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
IQGAP1P46940 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
IQGAP1P46940 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
IQGAP1P46940 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
IQGAP1P46940 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
IQGAP1P46940 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
IQGAP1P46940 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
IQGAP1P46940 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
IQGAP1P46940 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
IQGAP1P46940 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
IQGAP1P46940 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
IQGAP1P46940 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
IQGAP1P46940 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
IQGAP1P46940 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
IQGAP1P46940 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
IQGAP1P46940 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
IQGAP1P46940 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.21■■■■□ 3.87
IQGAP1P46940 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
IQGAP1P46940 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
IQGAP1P46940 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms