Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.13■■■■■ 5.62
IQGAP1P46940 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.84■■■■■ 5.57
IQGAP1P46940 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.58■■■■■ 5.53
IQGAP1P46940 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
IQGAP1P46940 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
IQGAP1P46940 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
IQGAP1P46940 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.89■■■■■ 5.26
IQGAP1P46940 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
IQGAP1P46940 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
IQGAP1P46940 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
IQGAP1P46940 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
IQGAP1P46940 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
IQGAP1P46940 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
IQGAP1P46940 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
IQGAP1P46940 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
IQGAP1P46940 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
IQGAP1P46940 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
IQGAP1P46940 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
IQGAP1P46940 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.04
IQGAP1P46940 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
IQGAP1P46940 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
IQGAP1P46940 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
IQGAP1P46940 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
IQGAP1P46940 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
IQGAP1P46940 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
IQGAP1P46940 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
IQGAP1P46940 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
IQGAP1P46940 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
IQGAP1P46940 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
IQGAP1P46940 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
IQGAP1P46940 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.92
IQGAP1P46940 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
IQGAP1P46940 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
IQGAP1P46940 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
IQGAP1P46940 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
IQGAP1P46940 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
IQGAP1P46940 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
IQGAP1P46940 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
IQGAP1P46940 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
IQGAP1P46940 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
IQGAP1P46940 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
IQGAP1P46940 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
IQGAP1P46940 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
IQGAP1P46940 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
IQGAP1P46940 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
IQGAP1P46940 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
IQGAP1P46940 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
IQGAP1P46940 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
IQGAP1P46940 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
IQGAP1P46940 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
IQGAP1P46940 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
IQGAP1P46940 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
IQGAP1P46940 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
IQGAP1P46940 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
IQGAP1P46940 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
IQGAP1P46940 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.66
IQGAP1P46940 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
IQGAP1P46940 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
IQGAP1P46940 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
IQGAP1P46940 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
IQGAP1P46940 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
IQGAP1P46940 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
IQGAP1P46940 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
IQGAP1P46940 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
IQGAP1P46940 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
IQGAP1P46940 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
IQGAP1P46940 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
IQGAP1P46940 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
IQGAP1P46940 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
IQGAP1P46940 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
IQGAP1P46940 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
IQGAP1P46940 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
IQGAP1P46940 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
IQGAP1P46940 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
IQGAP1P46940 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
IQGAP1P46940 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
IQGAP1P46940 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
IQGAP1P46940 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
IQGAP1P46940 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
IQGAP1P46940 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
IQGAP1P46940 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
IQGAP1P46940 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
IQGAP1P46940 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
IQGAP1P46940 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
IQGAP1P46940 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
IQGAP1P46940 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
IQGAP1P46940 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
IQGAP1P46940 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
IQGAP1P46940 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
IQGAP1P46940 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
IQGAP1P46940 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
IQGAP1P46940 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
IQGAP1P46940 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
IQGAP1P46940 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
IQGAP1P46940 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
IQGAP1P46940 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
IQGAP1P46940 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
IQGAP1P46940 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
IQGAP1P46940 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
IQGAP1P46940 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms