Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1BP36896 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1BP36896 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACVR1BP36896 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1BP36896 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1BP36896 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1BP36896 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1BP36896 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1BP36896 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACVR1BP36896 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACVR1BP36896 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACVR1BP36896 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVR1BP36896 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACVR1BP36896 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1BP36896 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms