Protein–RNA interactions for Protein: P26367

PAX6, Paired box protein Pax-6, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX6P26367 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX6P26367 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX6P26367 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX6P26367 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX6P26367 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX6P26367 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX6P26367 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX6P26367 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX6P26367 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX6P26367 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX6P26367 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX6P26367 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX6P26367 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX6P26367 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX6P26367 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX6P26367 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX6P26367 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX6P26367 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX6P26367 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX6P26367 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX6P26367 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX6P26367 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX6P26367 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX6P26367 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX6P26367 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX6P26367 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX6P26367 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX6P26367 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX6P26367 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX6P26367 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX6P26367 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX6P26367 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX6P26367 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX6P26367 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX6P26367 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX6P26367 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX6P26367 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX6P26367 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX6P26367 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX6P26367 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX6P26367 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX6P26367 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX6P26367 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX6P26367 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX6P26367 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX6P26367 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAX6P26367 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAX6P26367 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX6P26367 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX6P26367 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX6P26367 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX6P26367 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX6P26367 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX6P26367 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX6P26367 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX6P26367 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX6P26367 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX6P26367 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX6P26367 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX6P26367 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX6P26367 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX6P26367 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX6P26367 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX6P26367 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX6P26367 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX6P26367 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX6P26367 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX6P26367 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX6P26367 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX6P26367 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX6P26367 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX6P26367 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX6P26367 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX6P26367 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX6P26367 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX6P26367 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX6P26367 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX6P26367 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX6P26367 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX6P26367 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX6P26367 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX6P26367 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX6P26367 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX6P26367 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX6P26367 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX6P26367 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX6P26367 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX6P26367 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX6P26367 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX6P26367 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX6P26367 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX6P26367 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX6P26367 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX6P26367 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX6P26367 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX6P26367 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX6P26367 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX6P26367 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX6P26367 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX6P26367 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms