Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TAF1P21675 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TAF1P21675 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TAF1P21675 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TAF1P21675 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TAF1P21675 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TAF1P21675 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TAF1P21675 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TAF1P21675 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TAF1P21675 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TAF1P21675 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TAF1P21675 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TAF1P21675 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TAF1P21675 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TAF1P21675 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TAF1P21675 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TAF1P21675 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TAF1P21675 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TAF1P21675 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TAF1P21675 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TAF1P21675 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TAF1P21675 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TAF1P21675 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TAF1P21675 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TAF1P21675 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TAF1P21675 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TAF1P21675 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TAF1P21675 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TAF1P21675 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TAF1P21675 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TAF1P21675 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TAF1P21675 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TAF1P21675 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
TAF1P21675 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TAF1P21675 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TAF1P21675 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TAF1P21675 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TAF1P21675 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TAF1P21675 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TAF1P21675 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TAF1P21675 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TAF1P21675 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TAF1P21675 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
TAF1P21675 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TAF1P21675 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TAF1P21675 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TAF1P21675 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TAF1P21675 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TAF1P21675 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TAF1P21675 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TAF1P21675 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TAF1P21675 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TAF1P21675 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TAF1P21675 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TAF1P21675 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TAF1P21675 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TAF1P21675 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TAF1P21675 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TAF1P21675 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TAF1P21675 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TAF1P21675 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TAF1P21675 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TAF1P21675 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TAF1P21675 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TAF1P21675 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TAF1P21675 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TAF1P21675 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TAF1P21675 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TAF1P21675 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TAF1P21675 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TAF1P21675 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TAF1P21675 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TAF1P21675 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TAF1P21675 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TAF1P21675 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TAF1P21675 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TAF1P21675 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TAF1P21675 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TAF1P21675 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TAF1P21675 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TAF1P21675 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TAF1P21675 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TAF1P21675 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TAF1P21675 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TAF1P21675 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TAF1P21675 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TAF1P21675 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TAF1P21675 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TAF1P21675 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TAF1P21675 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TAF1P21675 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TAF1P21675 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TAF1P21675 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TAF1P21675 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TAF1P21675 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TAF1P21675 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TAF1P21675 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TAF1P21675 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TAF1P21675 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TAF1P21675 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms