Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GM2AP17900 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GM2AP17900 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GM2AP17900 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GM2AP17900 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GM2AP17900 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GM2AP17900 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GM2AP17900 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GM2AP17900 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GM2AP17900 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GM2AP17900 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GM2AP17900 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GM2AP17900 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GM2AP17900 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GM2AP17900 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GM2AP17900 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GM2AP17900 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GM2AP17900 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GM2AP17900 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GM2AP17900 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GM2AP17900 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GM2AP17900 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GM2AP17900 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GM2AP17900 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GM2AP17900 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GM2AP17900 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GM2AP17900 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GM2AP17900 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GM2AP17900 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GM2AP17900 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GM2AP17900 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GM2AP17900 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GM2AP17900 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GM2AP17900 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GM2AP17900 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GM2AP17900 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GM2AP17900 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GM2AP17900 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GM2AP17900 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GM2AP17900 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GM2AP17900 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GM2AP17900 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GM2AP17900 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GM2AP17900 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GM2AP17900 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GM2AP17900 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GM2AP17900 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GM2AP17900 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GM2AP17900 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GM2AP17900 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GM2AP17900 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GM2AP17900 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GM2AP17900 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GM2AP17900 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GM2AP17900 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GM2AP17900 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GM2AP17900 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GM2AP17900 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GM2AP17900 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GM2AP17900 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GM2AP17900 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GM2AP17900 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GM2AP17900 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GM2AP17900 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GM2AP17900 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GM2AP17900 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GM2AP17900 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GM2AP17900 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GM2AP17900 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GM2AP17900 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GM2AP17900 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GM2AP17900 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GM2AP17900 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GM2AP17900 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GM2AP17900 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GM2AP17900 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GM2AP17900 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GM2AP17900 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GM2AP17900 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GM2AP17900 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GM2AP17900 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GM2AP17900 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GM2AP17900 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GM2AP17900 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GM2AP17900 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GM2AP17900 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GM2AP17900 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GM2AP17900 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GM2AP17900 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GM2AP17900 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GM2AP17900 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GM2AP17900 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GM2AP17900 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GM2AP17900 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GM2AP17900 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GM2AP17900 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GM2AP17900 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GM2AP17900 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GM2AP17900 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GM2AP17900 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms