Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ITGB4P16144 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGB4P16144 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGB4P16144 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGB4P16144 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITGB4P16144 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ITGB4P16144 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ITGB4P16144 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGB4P16144 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ITGB4P16144 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ITGB4P16144 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGB4P16144 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGB4P16144 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITGB4P16144 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGB4P16144 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGB4P16144 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGB4P16144 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ITGB4P16144 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGB4P16144 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGB4P16144 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITGB4P16144 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ITGB4P16144 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ITGB4P16144 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ITGB4P16144 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ITGB4P16144 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ITGB4P16144 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ITGB4P16144 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGB4P16144 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ITGB4P16144 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITGB4P16144 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ITGB4P16144 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ITGB4P16144 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGB4P16144 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ITGB4P16144 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms