Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DEFA4P12838 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DEFA4P12838 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA4P12838 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA4P12838 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA4P12838 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms