Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFHP12036 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFHP12036 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFHP12036 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFHP12036 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFHP12036 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFHP12036 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFHP12036 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEFHP12036 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFHP12036 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFHP12036 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFHP12036 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFHP12036 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFHP12036 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFHP12036 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFHP12036 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFHP12036 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEFHP12036 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFHP12036 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFHP12036 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFHP12036 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFHP12036 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFHP12036 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFHP12036 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFHP12036 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFHP12036 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFHP12036 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFHP12036 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFHP12036 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFHP12036 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFHP12036 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFHP12036 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFHP12036 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFHP12036 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFHP12036 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFHP12036 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFHP12036 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFHP12036 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFHP12036 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFHP12036 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFHP12036 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFHP12036 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFHP12036 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFHP12036 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFHP12036 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFHP12036 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFHP12036 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFHP12036 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFHP12036 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFHP12036 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFHP12036 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFHP12036 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFHP12036 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFHP12036 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFHP12036 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFHP12036 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFHP12036 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFHP12036 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFHP12036 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFHP12036 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFHP12036 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFHP12036 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFHP12036 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFHP12036 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFHP12036 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFHP12036 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFHP12036 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFHP12036 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFHP12036 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFHP12036 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFHP12036 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFHP12036 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFHP12036 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFHP12036 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFHP12036 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFHP12036 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFHP12036 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFHP12036 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFHP12036 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFHP12036 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFHP12036 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFHP12036 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFHP12036 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFHP12036 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFHP12036 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFHP12036 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFHP12036 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFHP12036 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFHP12036 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFHP12036 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFHP12036 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFHP12036 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFHP12036 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFHP12036 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFHP12036 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFHP12036 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFHP12036 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFHP12036 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFHP12036 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFHP12036 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms