Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC48.96■■■■■ 5.43
TOP2AP11388 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC48.95■■■■■ 5.43
TOP2AP11388 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
TOP2AP11388 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
TOP2AP11388 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
TOP2AP11388 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
TOP2AP11388 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
TOP2AP11388 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC48.88■■■■■ 5.41
TOP2AP11388 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC48.88■■■■■ 5.41
TOP2AP11388 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC48.88■■■■■ 5.41
TOP2AP11388 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
TOP2AP11388 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
TOP2AP11388 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
TOP2AP11388 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
TOP2AP11388 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC48.8■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC48.79■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
TOP2AP11388 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
TOP2AP11388 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC48.73■■■■■ 5.39
TOP2AP11388 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
TOP2AP11388 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
TOP2AP11388 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.71■■■■■ 5.39
TOP2AP11388 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC48.71■■■■■ 5.39
TOP2AP11388 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC48.7■■■■■ 5.39
TOP2AP11388 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
TOP2AP11388 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC48.67■■■■■ 5.38
TOP2AP11388 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
TOP2AP11388 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
TOP2AP11388 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
TOP2AP11388 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC48.66■■■■■ 5.38
TOP2AP11388 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC48.66■■■■■ 5.38
TOP2AP11388 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
TOP2AP11388 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC48.63■■■■■ 5.37
TOP2AP11388 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC48.63■■■■■ 5.37
TOP2AP11388 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC48.62■■■■■ 5.37
TOP2AP11388 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
TOP2AP11388 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC48.58■■■■■ 5.37
TOP2AP11388 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
TOP2AP11388 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
TOP2AP11388 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
TOP2AP11388 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
TOP2AP11388 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC48.5■■■■■ 5.36
TOP2AP11388 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
TOP2AP11388 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
TOP2AP11388 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
TOP2AP11388 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
TOP2AP11388 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
TOP2AP11388 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
TOP2AP11388 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
TOP2AP11388 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
TOP2AP11388 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.42■■■■■ 5.34
TOP2AP11388 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
TOP2AP11388 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
TOP2AP11388 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
TOP2AP11388 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.37■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC48.37■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC48.34■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC48.34■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.33■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC48.33■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC48.33■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
TOP2AP11388 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
TOP2AP11388 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC48.3■■■■■ 5.32
TOP2AP11388 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
TOP2AP11388 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
TOP2AP11388 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
TOP2AP11388 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
TOP2AP11388 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC48.26■■■■■ 5.32
TOP2AP11388 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.32
TOP2AP11388 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
TOP2AP11388 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
TOP2AP11388 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
TOP2AP11388 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
TOP2AP11388 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
TOP2AP11388 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
TOP2AP11388 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
TOP2AP11388 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
TOP2AP11388 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
TOP2AP11388 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
TOP2AP11388 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
TOP2AP11388 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
TOP2AP11388 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
TOP2AP11388 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
TOP2AP11388 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
TOP2AP11388 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
TOP2AP11388 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
TOP2AP11388 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.08■■■■■ 5.29
TOP2AP11388 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
TOP2AP11388 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms