Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRFP10586 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRFP10586 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRFP10586 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRFP10586 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRFP10586 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRFP10586 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRFP10586 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRFP10586 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRFP10586 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRFP10586 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRFP10586 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRFP10586 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRFP10586 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRFP10586 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRFP10586 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRFP10586 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRFP10586 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRFP10586 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRFP10586 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRFP10586 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRFP10586 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRFP10586 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRFP10586 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRFP10586 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRFP10586 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRFP10586 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRFP10586 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRFP10586 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRFP10586 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRFP10586 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRFP10586 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRFP10586 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms