Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RGPD2P0DJD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RGPD2P0DJD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RGPD2P0DJD1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD2P0DJD1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RGPD2P0DJD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RGPD2P0DJD1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD2P0DJD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD2P0DJD1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RGPD2P0DJD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RGPD2P0DJD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RGPD2P0DJD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RGPD2P0DJD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RGPD2P0DJD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
RGPD2P0DJD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RGPD2P0DJD1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RGPD2P0DJD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
RGPD2P0DJD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RGPD2P0DJD1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RGPD2P0DJD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD2P0DJD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD2P0DJD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RGPD2P0DJD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RGPD2P0DJD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RGPD2P0DJD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD2P0DJD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RGPD2P0DJD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RGPD2P0DJD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RGPD2P0DJD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RGPD2P0DJD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RGPD2P0DJD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RGPD2P0DJD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RGPD2P0DJD1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RGPD2P0DJD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RGPD2P0DJD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms