Protein–RNA interactions for Protein: P0CG32

ZCCHC18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC18P0CG32 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZCCHC18P0CG32 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC18P0CG32 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC18P0CG32 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC18P0CG32 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC18P0CG32 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC18P0CG32 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC18P0CG32 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC18P0CG32 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms