Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPBP07988 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPBP07988 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPBP07988 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPBP07988 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPBP07988 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPBP07988 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPBP07988 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPBP07988 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPBP07988 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPBP07988 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPBP07988 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPBP07988 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPBP07988 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPBP07988 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFTPBP07988 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPBP07988 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPBP07988 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPBP07988 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPBP07988 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms