Protein–RNA interactions for Protein: P07947

YES1, Tyrosine-protein kinase Yes, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YES1P07947 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YES1P07947 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YES1P07947 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YES1P07947 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YES1P07947 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YES1P07947 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YES1P07947 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YES1P07947 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YES1P07947 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YES1P07947 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YES1P07947 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YES1P07947 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YES1P07947 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
YES1P07947 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
YES1P07947 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YES1P07947 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YES1P07947 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YES1P07947 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YES1P07947 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YES1P07947 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YES1P07947 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YES1P07947 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YES1P07947 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YES1P07947 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YES1P07947 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YES1P07947 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YES1P07947 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YES1P07947 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YES1P07947 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YES1P07947 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YES1P07947 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YES1P07947 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YES1P07947 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YES1P07947 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YES1P07947 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YES1P07947 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YES1P07947 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YES1P07947 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YES1P07947 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YES1P07947 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YES1P07947 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YES1P07947 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YES1P07947 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YES1P07947 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YES1P07947 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YES1P07947 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YES1P07947 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YES1P07947 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YES1P07947 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YES1P07947 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YES1P07947 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YES1P07947 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YES1P07947 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YES1P07947 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YES1P07947 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YES1P07947 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
YES1P07947 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YES1P07947 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YES1P07947 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YES1P07947 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YES1P07947 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YES1P07947 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YES1P07947 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YES1P07947 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YES1P07947 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
YES1P07947 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YES1P07947 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YES1P07947 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YES1P07947 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YES1P07947 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YES1P07947 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YES1P07947 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YES1P07947 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YES1P07947 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YES1P07947 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YES1P07947 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YES1P07947 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YES1P07947 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YES1P07947 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YES1P07947 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YES1P07947 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YES1P07947 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YES1P07947 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YES1P07947 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YES1P07947 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YES1P07947 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YES1P07947 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YES1P07947 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YES1P07947 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YES1P07947 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YES1P07947 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YES1P07947 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YES1P07947 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YES1P07947 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YES1P07947 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YES1P07947 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
YES1P07947 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YES1P07947 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YES1P07947 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YES1P07947 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms