Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TK1P04183 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TK1P04183 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TK1P04183 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TK1P04183 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TK1P04183 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TK1P04183 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TK1P04183 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TK1P04183 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TK1P04183 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TK1P04183 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TK1P04183 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TK1P04183 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TK1P04183 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TK1P04183 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TK1P04183 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TK1P04183 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TK1P04183 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TK1P04183 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TK1P04183 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TK1P04183 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TK1P04183 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TK1P04183 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TK1P04183 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TK1P04183 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TK1P04183 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TK1P04183 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TK1P04183 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TK1P04183 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TK1P04183 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TK1P04183 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK1P04183 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK1P04183 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK1P04183 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK1P04183 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK1P04183 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK1P04183 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK1P04183 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK1P04183 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK1P04183 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK1P04183 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK1P04183 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK1P04183 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TK1P04183 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK1P04183 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TK1P04183 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TK1P04183 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TK1P04183 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TK1P04183 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TK1P04183 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TK1P04183 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TK1P04183 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TK1P04183 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TK1P04183 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TK1P04183 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TK1P04183 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TK1P04183 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TK1P04183 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TK1P04183 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TK1P04183 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TK1P04183 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TK1P04183 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TK1P04183 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TK1P04183 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TK1P04183 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TK1P04183 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TK1P04183 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TK1P04183 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TK1P04183 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TK1P04183 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TK1P04183 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TK1P04183 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TK1P04183 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TK1P04183 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TK1P04183 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TK1P04183 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TK1P04183 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TK1P04183 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TK1P04183 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TK1P04183 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TK1P04183 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TK1P04183 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TK1P04183 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TK1P04183 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TK1P04183 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TK1P04183 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TK1P04183 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TK1P04183 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TK1P04183 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TK1P04183 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TK1P04183 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TK1P04183 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TK1P04183 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TK1P04183 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TK1P04183 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TK1P04183 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TK1P04183 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TK1P04183 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TK1P04183 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TK1P04183 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms