Protein–RNA interactions for Protein: P01715

IGLV3-1, Immunoglobulin lambda variable 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-1P01715 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGLV3-1P01715 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGLV3-1P01715 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGLV3-1P01715 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGLV3-1P01715 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGLV3-1P01715 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGLV3-1P01715 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGLV3-1P01715 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGLV3-1P01715 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGLV3-1P01715 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGLV3-1P01715 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGLV3-1P01715 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGLV3-1P01715 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGLV3-1P01715 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGLV3-1P01715 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGLV3-1P01715 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms