Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA17P01571 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA17P01571 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNA17P01571 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNA17P01571 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA17P01571 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IFNA17P01571 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms