Protein–RNA interactions for Protein: O95969

SCGB1D2, Secretoglobin family 1D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D2O95969 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCGB1D2O95969 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB1D2O95969 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCGB1D2O95969 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCGB1D2O95969 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCGB1D2O95969 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGB1D2O95969 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCGB1D2O95969 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCGB1D2O95969 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGB1D2O95969 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCGB1D2O95969 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCGB1D2O95969 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB1D2O95969 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGB1D2O95969 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB1D2O95969 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms