Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX30O94993 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX30O94993 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX30O94993 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX30O94993 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX30O94993 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX30O94993 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX30O94993 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX30O94993 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX30O94993 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX30O94993 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX30O94993 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX30O94993 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX30O94993 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX30O94993 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX30O94993 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX30O94993 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX30O94993 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX30O94993 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX30O94993 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX30O94993 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX30O94993 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX30O94993 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX30O94993 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX30O94993 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX30O94993 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX30O94993 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX30O94993 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX30O94993 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX30O94993 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX30O94993 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX30O94993 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX30O94993 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX30O94993 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX30O94993 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX30O94993 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX30O94993 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX30O94993 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX30O94993 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX30O94993 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX30O94993 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX30O94993 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX30O94993 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX30O94993 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX30O94993 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX30O94993 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX30O94993 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX30O94993 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX30O94993 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX30O94993 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX30O94993 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX30O94993 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX30O94993 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX30O94993 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX30O94993 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX30O94993 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX30O94993 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX30O94993 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX30O94993 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX30O94993 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX30O94993 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX30O94993 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX30O94993 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX30O94993 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX30O94993 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX30O94993 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX30O94993 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX30O94993 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX30O94993 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX30O94993 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX30O94993 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX30O94993 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX30O94993 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX30O94993 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX30O94993 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX30O94993 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX30O94993 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX30O94993 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX30O94993 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX30O94993 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX30O94993 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX30O94993 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX30O94993 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX30O94993 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX30O94993 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX30O94993 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX30O94993 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX30O94993 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX30O94993 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX30O94993 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX30O94993 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX30O94993 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX30O94993 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX30O94993 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX30O94993 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX30O94993 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX30O94993 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX30O94993 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX30O94993 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX30O94993 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms