Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
USP19O94966 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
USP19O94966 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP19O94966 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP19O94966 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP19O94966 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
USP19O94966 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
USP19O94966 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
USP19O94966 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
USP19O94966 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
USP19O94966 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
USP19O94966 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
USP19O94966 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
USP19O94966 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
USP19O94966 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
USP19O94966 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
USP19O94966 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
USP19O94966 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
USP19O94966 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
USP19O94966 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
USP19O94966 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
USP19O94966 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
USP19O94966 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
USP19O94966 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
USP19O94966 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
USP19O94966 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
USP19O94966 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
USP19O94966 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
USP19O94966 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
USP19O94966 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
USP19O94966 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
USP19O94966 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
USP19O94966 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
USP19O94966 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
USP19O94966 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
USP19O94966 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
USP19O94966 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
USP19O94966 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
USP19O94966 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
USP19O94966 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
USP19O94966 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
USP19O94966 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
USP19O94966 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
USP19O94966 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
USP19O94966 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
USP19O94966 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
USP19O94966 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
USP19O94966 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
USP19O94966 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
USP19O94966 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
USP19O94966 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
USP19O94966 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
USP19O94966 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
USP19O94966 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
USP19O94966 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
USP19O94966 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
USP19O94966 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
USP19O94966 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
USP19O94966 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
USP19O94966 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
USP19O94966 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
USP19O94966 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
USP19O94966 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
USP19O94966 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
USP19O94966 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
USP19O94966 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
USP19O94966 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
USP19O94966 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
USP19O94966 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
USP19O94966 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
USP19O94966 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
USP19O94966 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
USP19O94966 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
USP19O94966 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
USP19O94966 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
USP19O94966 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
USP19O94966 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
USP19O94966 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
USP19O94966 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
USP19O94966 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
USP19O94966 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
USP19O94966 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP19O94966 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP19O94966 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP19O94966 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP19O94966 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
USP19O94966 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
USP19O94966 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
USP19O94966 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
USP19O94966 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
USP19O94966 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
USP19O94966 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
USP19O94966 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
USP19O94966 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
USP19O94966 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
USP19O94966 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
USP19O94966 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
USP19O94966 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
USP19O94966 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
USP19O94966 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms