Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTSS1O43312 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTSS1O43312 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTSS1O43312 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTSS1O43312 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MTSS1O43312 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTSS1O43312 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MTSS1O43312 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTSS1O43312 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTSS1O43312 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTSS1O43312 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTSS1O43312 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTSS1O43312 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTSS1O43312 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MTSS1O43312 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTSS1O43312 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTSS1O43312 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTSS1O43312 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTSS1O43312 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTSS1O43312 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTSS1O43312 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTSS1O43312 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTSS1O43312 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTSS1O43312 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTSS1O43312 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTSS1O43312 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTSS1O43312 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms