Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF646O15015 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZNF646O15015 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZNF646O15015 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ZNF646O15015 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF646O15015 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF646O15015 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF646O15015 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF646O15015 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF646O15015 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF646O15015 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF646O15015 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF646O15015 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF646O15015 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZNF646O15015 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF646O15015 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZNF646O15015 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZNF646O15015 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZNF646O15015 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZNF646O15015 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF646O15015 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms