Protein–RNA interactions for Protein: O00308

WWP2, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP2O00308 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WWP2O00308 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WWP2O00308 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WWP2O00308 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WWP2O00308 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WWP2O00308 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WWP2O00308 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WWP2O00308 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WWP2O00308 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WWP2O00308 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WWP2O00308 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WWP2O00308 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WWP2O00308 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
WWP2O00308 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
WWP2O00308 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WWP2O00308 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WWP2O00308 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
WWP2O00308 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WWP2O00308 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WWP2O00308 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WWP2O00308 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WWP2O00308 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WWP2O00308 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WWP2O00308 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WWP2O00308 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WWP2O00308 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WWP2O00308 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WWP2O00308 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WWP2O00308 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WWP2O00308 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WWP2O00308 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WWP2O00308 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WWP2O00308 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WWP2O00308 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WWP2O00308 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WWP2O00308 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WWP2O00308 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WWP2O00308 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WWP2O00308 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WWP2O00308 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WWP2O00308 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WWP2O00308 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WWP2O00308 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WWP2O00308 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WWP2O00308 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WWP2O00308 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WWP2O00308 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WWP2O00308 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WWP2O00308 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WWP2O00308 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WWP2O00308 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WWP2O00308 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WWP2O00308 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WWP2O00308 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WWP2O00308 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WWP2O00308 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WWP2O00308 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WWP2O00308 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WWP2O00308 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WWP2O00308 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WWP2O00308 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WWP2O00308 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WWP2O00308 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
WWP2O00308 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WWP2O00308 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WWP2O00308 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WWP2O00308 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WWP2O00308 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WWP2O00308 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WWP2O00308 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WWP2O00308 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WWP2O00308 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WWP2O00308 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WWP2O00308 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WWP2O00308 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WWP2O00308 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WWP2O00308 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WWP2O00308 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WWP2O00308 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WWP2O00308 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WWP2O00308 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WWP2O00308 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WWP2O00308 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WWP2O00308 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WWP2O00308 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WWP2O00308 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WWP2O00308 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WWP2O00308 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WWP2O00308 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WWP2O00308 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WWP2O00308 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WWP2O00308 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
WWP2O00308 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WWP2O00308 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WWP2O00308 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WWP2O00308 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WWP2O00308 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WWP2O00308 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WWP2O00308 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WWP2O00308 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms